2016-03-09 温州医科大学基因组医学研究院孙中生[院长]课题组2016考研究生调剂信息

高校名称：温州医科大学

所在省市：浙江

调剂专业：生物信息学 、基因组学、遗传学
、分子生物学

是否有公费名额：未知

发布时间：2016-03-09

截止时间：未注明

温州医科大学基因组医学研究院孙中生教授（院长）课题组基于国家发展战略和十三五规划（“脑科学与类脑研究 ” ，“加速推进基因组学等生物技术大规模应用”），主要利用基因组学、生物信息学 、医学遗传学
、表观遗传学、分子生物学等研究手段从事复杂疾病 、特别是神经精神类疾病（例如
，孤独症
、智力低下）和癌症的遗传学机制研究 。本课题组经费充足，已经申请到多个国家级课题 ，具有各种生物学实验平台、生物信息学分析平台 、具有良好的发展前景。科学研究上
，本课题组在导师和学生的共同努力下，取得了多项突破性成功：

1
、首次发现并报道节律基因PER1和PER2；

2、开发二代测序可视化工具MagicViewer和SplicingViewer ，普通电脑可完成大数据可视化；

3 、开发MicroRNA在线分析工具
，被评为业内最准确的工具之一；

4
、通过全外显子测序鉴定到中国第一个孤独症致病基因ANK3；

5、通过高通量测序鉴定肌萎缩侧索硬化症致病基因SOD1；

6 、开发了第一款全面的在线的甲基化分析软件RRBS-Analyser；

7、开发了癫痫相关突变与基因数据库EpilepsyGene；

8
、开发了第一款在线分析新生突变的工具mirTrios；

9、基于新生突变，首先系统分析神经精神疾病的共有基因和通路 ，并开发NPdenovo数据库；

10 、开发低起始量
，单精度的DNA甲基化图谱的实验与分析方法MBRidge；

11
、开发单细胞DNA甲基化图谱的实验与分析方法Q-RRBS；

12、开发第一款RNA结合蛋白调控数据库RBP-Var；

13 、首次使用全基因组测序分析中国自闭症患者突变图谱；

14
、首次鉴定到多个自闭症新基因并进行了深入的分子机制研究；

本课题组在Cell,MolecularPsychiatry,PNAS,NucleicAcidsResearch,JournalofMolecularCellBiology,GeneticsinMedicine等国际权威杂志
。目前本课题组还有多个基因组学，分子生物学、神经科学的文章Science 、NatureGenetics
、NatureNeuroscience、MolecularPsychiatry 、AnnalsofNeurology等杂志审稿。

调剂名额：

生物信息学
、基因组学等方向2-3名 ，遗传学、分子生物学等方向1-2名
，共计4-5名 。

如有意向且符合条件者，请将简历发送至邮件tianguolangzi@yahoo.com ，我们会根据实际情况回复调剂生
。联系方式：张坤18257737467

导师介绍：

孙中生教授简介如下：

博士，研究员
，博士生导师，中国遗传学会表观遗传专业委员会主任,HormonesandBehavior杂志编委。1982年北京大学学士；1992年美国德克萨斯A&M大学博士；1993-1998年先后在德克萨斯大学安德生癌症研究中心放射治疗系 、贝勒医学院分子人类遗传学系做博士后；1998-1999年任路易斯安那州立大学神经科学中心助理教授、主任助理 ，同时任生物化学和遗传系助理教授；1999-2005年在美国康奈尔大学任助理教授
，威尔医学院特护医学实验室主任；2005-2010年在中国科学院心理研究所行为遗传学中心任研究员，2010年至今任北京生科院研究员 。1997年,荣获Science杂志十大科学突破 ，2006年入选中科院“百人计划
”
，并入选“新世纪百千万人才工程”
。http://sourcedb.biols.cas.cn/cn/rck/yjdw/201309/t20130922_3936098.html

学生待遇：

1
、每月发放不低于1300元的生活补贴；

2、所有在读研究生均享受8000－10000元/年的助学金，可抵消全部学费；

3 、研究生期间 ，学生均有自己独立负责的课题
，同时参与
、合作课题组其他相关课题；

应聘要求：

1.本次招生重点面对生物信息学、基因组学 、遗传学
、分子生物学等专业；

2.同时欢迎有医学、计算机 、数学背景的毕业生；

3.良好的英语阅读写作及听说交流能力；

4.吃苦耐劳，有探索精神 ，对生命科学研究有浓厚兴趣；

5.有计算机操作
、编程基础者或者相关生物实验经验者优先；

6.硕士毕业后有意向继续深造者优先；

7.符合温州医科大学硕士研究生招生调剂条件：http://yjsy.wmu.edu.cn/

培养方案：

不用担心基础
，只要你不荒废时间，师兄师姐带你进步。前半年可能在温州修完所有课程 ，后面所有学生都有机会到北京中科院学习和工作，进行联合培养 。我们对入学的同学进行集中培训
，包括入门和进阶
。在培训方面，我们积累到足够多的经验。等打好基础后 ，我们根据喜好分配你擅长的任务和课题 。天道酬勤
，有付出才有收获
。

三年结束后，大致两条路。

1、继续读博：

a) 、优秀硕士生可直接进入中科院攻读博士学位（导师在中科院也招生）；

b)
、优秀硕士毕业生可推荐进入中南大学、东南大学等其他国内一流大学攻读博士学位；

2 、工作：

我们会让你在硕士期间得到充分的锻炼 ，将生物信息学技术运用到炉火纯青的地步
，包括但不限于精通shell，R处理数据及作图 ，Python和perl分析处理大数据
，PHP建站，MySQL建立数据库 ，PS等 。生物信息工程师目前的薪资
，可以自己查。我们实验室出去的学生的月薪一万起步
。

学术成果：

2016年：

WeipingTian,JiesiWang,KeZhang,HuajingTeng,ChongLi,MosheSzyf,ZhongShengSun&MeiZhao.Demethylationofc-MYBbindingsitemediatesupregulationofBdnfIVincocaine-conditionedplacepreferenceOPEN.ScientificReports,2016.(IF=5.578)

2015年：

LiJC,CaiT,JiangY,ChenHQ,HeX,ChenC,LiXF,ShaoQZ,RanX,LiZS,XiaK,LiuCY,SunZS,WuJY.GeneswithdenovomutationsaresharedbyfourneuropsychiatricdisordersdiscoveredfromNPdenovodatabase.MolecularPsychiatry,2015.(IF=15.147)

WanshiCai,FengbiaoMao,HuajingTeng,TaoCai,FangqingZhao,JinyuWuandZhongShengSun.MBRidgeAnaccurateandcost-effectivemethodforprofilingDNAmethylomeatsingle-baseresolution.JournalofMoleucularCellBiology,2015.(IF=6.771)

FengbiaoMao,LuoyuanXiao,XianfengLi,JialongLiang,HuajingTeng,WanshiCai,andZhongShengSun.RBP-Var:adatabaseoffunctionalvariantsinvolvedinregulationmediatedbyRNA-bindingproteins.NUCLEICACIDSRESEARCH,2015.(IF=9.112)

KangliWanga,XianfengLibc,ShanshanDonga,JialongLiangbd,FengbiaoMaobd,ChengZengb,HonghuWua,JinyuWuab,WanshiCaib&ZhongShengSunab.Q-RRBSAquantitativereducedrepresentationbisulfitesequencingmethodforsingle-cellmethylomeanalyses.Epigenetics,2015.(IF=4.780)

2014年：

YanWang,GuilingLi,FengbiaoMao,XianfengLi,QiLiu,LinChen,LuLv,XinWang,JinyuWu,WeiDai,GuanWang,EnfengZhao,Kai-FuTangandZhongShengSun.Ras-inducedEpigeneticInactivationoftheRRADRas-relatedAssociatedwithDiabetesGenePromotesGlucoseUptakeinaHumanOvarianCancerModel.JURNALOFBIOLOGICALCHEMISTRY,2014.(IF=4.573)

QingXie,QiLiu,FengbiaoMao,WanshiCai,HonghuWu,MingcongYou,ZhenWang,BingyuChen,ZhongShengSun,JinyuWu.ABayesianFrameworktoIdentifyMethylcytosinesfromHigh-ThroughputBisulfiteSequencingData.PLOSComputationalBiology,2014.(IF=4.620)

XiaRan,JinchenLi,QianzhiShao,HuiqianChen,ZhongdongLin,ZhongShengSunandJinyuWu.EpilepsyGene:ageneticresourceforgenesandmutationsrelatedtoepilepsy.NUCLEICACIDSRESEARCH,2014.(IF=9.112)

2013年：

JinyuWu,QiLiu,XinWang,JiayongZheng,TaoWang,MingcongYou,ZhongShengSun&QinghuaShi.mirTools2.0fornon-codingRNAdiscoveryprofilingandfunctionalannotationbasedonhigh-throughputsequencing.RNABiology,2013.(IF=4.974)

TaoWang,QiLiu,XianfengLi,XiaobingWang,JinchenLi,XiaochunZhu,ZhongShengSun,JinyuWu.RRBS-AnalyserAComprehensiveWebServerforReducedRepresentationBisulfiteSequencingDataAnalysis.HUMANMUTATION,2013.(IF=5.144)

ZhanjunWang,WanshiCai,FangCui,TaoCai,ZhaohuiChen,FengbiaoMao,HuajingTeng,LinChen,JiesiWang,ZhongshengSun,XushengHuang,PingYu.IdentificationofanovelmissenseC7WmutationofSOD1inalargefamilialamyotrophiclateralsclerosispedigree.NEUROBIOLOGYOFAGING,2013.(IF=5.013)

YongqingWang1,YanWang1,QiLiu,GangXu,FengbiaoMao,TingtingQin,HuajingTeng,WanshiCai,PingYu,TaoCai,MeiZhao,ZhongShengSun,CongyingXie.ComparativeRNA-SeqanalysisrevealspotentialmechanismsmediatingtheconversiontoandrogenindependenceinanLNCaPprogressioncellmodel.CANCERLETTERS,2013.(IF=5.621)

2012年：

ChengBi,JinyuWu,TaoJiang,QiLiu,WanshiCai,PingYu,TaoCai,MeiZhao,Yong-huiJiang,andZhongShengSun.MutationsofANK3identifiedbyexomesequencingareassociatedwithAutismsusceptibility.HUMANMUTATION,2012.(IF=5.144)JinyuWu,EnjianShen,DashuangShi,ZhongShengSun&TaoCai.IdentificationofanovelCys146XmutationofSOD1infamilialamyotrophiclateralsclerosisbywhole-exomesequencing.GENETICSINMEDICINE2012.(IF=7.329)

2011年：

JianminWu1,GangWu,LuLv,Yong-FengRen,Xue-JiaoZhang,Yong-FengXue,GuilingLi,XinchengLu,ZhongShengSunandKai-FuTang.MicroRNA-34ainhibitsmigrationandinvasionofcoloncancercellsviatargetingtoFra-1.CARCINOGENESIS,2011.(IF=5.334)

2010年：

HuabinHou,FangqingZhao,LingLinZhou,ErleZhu,HuajingTeng,XiaokunLi,QiyuBao,JinyuWuandZhongshengSun.MagicViewerIntegratedsolutionfornext-generationsequencingdatavisualizationandgeneticvariationdetectionandannotation.NUCLEICACIDSRESEARCH,2010.(IF=9.112)

ErleZhu,FangqingZhao,GangXu,HuabinHou,LingLinZhou,XiaokunLi,ZhongshengSunandJinyuWu.MirToolsMicroRNAprofilinganddiscoverybasedonhigh-throughputsequencing.NUCLEICACIDSRESEARCH,2010.(IF=9.112)

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温州医科大学基因组医学研究院

2016年3月9日