导师信息#华中农业大学植物科学技术学院导师介绍#章元明

基本信息姓名:章元明出生年月:1965.5
性别:男硕/博导：博导
民族:汉开设课程：数量遗传学（研究生课程）
职称:教授研究方向：统计基因组学 、基因分子进化
、大豆遗传学
学位:农学博士

联系方式办公电话：
电子邮件：soyzhang@mail.hzau.edu.cn

个人简介调剂信息：
欢迎2015年报考数学专业、统计学专业 、生物信息学专业、计算机科学专业
、生物科学与农学专业硕士研究生调剂到统计基因组学团队！与章元明教授(soyzhang@mail.hzau.edu.cn)联系 。

主要研究方向：
1、统计基因组学：目前从事海量数据的遗传分析方法研究
。代表性论文：提出惩罚最大
似然方法（Heredity,SCI引用>50），参与提出Bayesian压缩估计方法（Genetics,
SCI引用接近100次）
2 、基因分子进化：目前从事基因组变异与复杂性状形成的分子进化机制研究。代表性论
文：基因组变异与豆科植物根瘤固氮(MBE2013 ，影响因子：14.308)
、禾本科植物高
淀粉含量(MBE2012,影响因子：10.353)和高蛋白质含量的分子进化机制
3、大豆遗传学：在TAG和MolBreeding等发表论文多篇

学术等兼职
1 、BMCGeneticsAssociateEditor2011-
2
、CanadianJournalofPlantScienceAssociateEditor2011-2016
3、作物学报编委2014-
4 、JournalofGeneticsStudyAssociateEditor2012-
5
、FrontiersinStatisticalGeneticsandMethodologyReviewEditor2011-
6、AustinBiometricsandBiostatisticsAssociateEditor
7 、南京农业大学学报（自然科学版）编委2007.01~2016.12
8
、江苏省第八届现场统计研究会理事2013.11-2017.11

工作经历
1、华中农业大学植物科技学院教授
，组建数量遗传学研究团队；
2 、南京农业大学农学院作物遗传育种专业，历任副教授（1999）和教授（2002） ，从事
统计基因组学、基因分子进化和大豆遗传学研究工作；其中，2003-2005年在美国加州大学
Riverside分校做统计遗传与基因组学博士后：
3
、西南大学荣昌分校
，历任见习助教、助教（1987） 、讲师（1992）
、副教授（1995）；
从事生物统计学的教学与应用研究工作，曾任重庆市遗传学会常务理事、动物科学系主任助理和
副主任 、重庆市荣昌县政协常委 。

获奖情况
1
、OutstandingAssociateEditorCanadianJournalofPlantScience2013
2、优秀硕士学位论文（李其刚）指导教师南京农业大学2013
3 、优秀硕士学位论文（徐宇）指导教师江苏省教育厅2012
4
、优秀博士学位论文（何小红）指导教师南京农业大学2012
5、《生物统计与田间试验》国家精品课程负责人（第2）教育部2007
6 、教育部新世纪优秀人才支持计划获得者教育部2005
7
、江苏省优秀博士学位论文获得者江苏省教育厅2004
8、南京农业大学优秀博士南京农业大学2004
9 、植物数量性状主基因-多基因遗传体系的分离分析方法教育部自然科学二等奖（第2）2003
10、南京农业大学奖教金获得者南京农业大学2000
、2002
11、四川省优秀青年骨干教师四川省教委1995

自1986年以来教学情况：
1 、自1987年3月以来 ，主讲本科生课程《生物统计学》
、《试验设计》、《非参数估计方法》；
2 、自2005年以来
，主讲研究生课程《数量遗传学》
、《高级生物统计学》、《试验设计》 、
《统计基因组学》
、《遗传数据分析》和《作物学进展----比较基因组学与进化基因组学

科研项目1、主持华中农业大学引进人才项目1项
2 、参加973项目2项(2006CB101708,2011CB109300)
3
、主持国家自然科学基金项目3项（30470998;30671333;30971848）；学术指导国家自然科学
基金项目4项（30900842;31000666;2013年两项）；
4、主持教育部新世纪优秀人才支持计划项目1项
5 、主持教育部高校博士点基金项目3项
6、主持教育部与人事部留学回国人员启动基金项目各1项
7
、主持江苏省自然科学基金项目2项、重庆市应用基础研究项目1项
8 、主持中央高校基本科研业务费创新团队项目1项
、参与中央高校基本科研业务费项目1项、
指导中央高校基本科研业务费项目2项
9 、主持作物遗传与种质创新国家重点实验室自主创新项目1项

发明专利及获奖情况1
、主持研制植物数量性状主基因+多基因混合遗传分析软件包SEA，近10余年来引用2000次以上；
（软件索取联系方式：soyzhang@mail.hzau.edu.cn）
2、偏分离群体连锁遗传图矫正软件包DistortedMap
(软件下载地址：http:///hdy/journal/v112/n5/suppinfo/hdy2013127s1.html)
3 、NCII遗传交配设计QTL上位性检测windows界面软件包

发表的论文及著作主要英文论文（*：通讯作者；#：同等贡献）
2015
56ZhouLing(#),WangShi-Bo(#),JianJianbo(#),GengQing-Chun,WenJia,Song
Qijian,WuZhenzhen,LiGuang-Jun,LiuYu-Qin,JimM.Dunwell,ZhangJin,Feng
Jian-YingFeng,NiuYuan,ZhangLi,RenWen-Long&ZhangYuan-Ming(*).2015.
Identificationofdomestication-relatedlociassociatedwithfloweringtimeand
seedsizeinsoybeanwiththeRAD-seqgenotypingmethod.ScientificReports5:
9350(DOI:10.1038/srep09350)(2013IF:5.078)
55BuSu-Hong(#),ZhaoXinwang(#),YiCan,WenJia,TuJinxing,Yuan-MingZhang*.
InteractedQTLmappinginpartialNCIIdesignprovidesevidencesforbreeding
bydesign.PLoSONE10(3):e0121034.doi:10.1371/journal.pone.0121034
2014
54XieF-T,NiuY,ZhangJ,BuS-H,ZhangH-Z,GengQ-C,FengJ-Y,ZhangY-M*.2014.Fine
mappingofquantitativetraitlociforseedsizetraitsinsoybean.MolecularBreeding
34:2165-2178
53MengLi,XiaoleiLiu,PeterBradbury,JianmingYu,Yuan-MingZhang*,RoryJTodhunter,
EdwardSBuckler,ZhiwuZhang*.2014.Enrichmentofstatisticalpowerforgenome-wide
associationstudies.BMCBiology12:73(2013IF:7.43)
52XieShang-Qian,FengJian-Ying,ZhangY-M*.2014.Linkagegroupcorrectionusingepistatic
distortedmarkersinF2andbackcrosspopulations.Heredity112:479-488
51ZhangW-J,NiuY,BuS-H,LiM,FengJ-Y,ZhangJ,YangS-X,MedrineMmyiOdinga,Wei
S-P,LiuX-F,ZhangY-M*.2014.Epistaticassociationmappingforalkalineandsalinity
tolerancetraitsinthesoybeangerminationstage.PLoSONE9(1):e84750
2013
50LiQi-Gang,ZhangLi,LiChun,ZhangY-M*.2013.Comparativegenomicssuggeststhatan
ancestralpolyploidyeventleadstoenhancedrootnodulesymbiosisinthePapilionoideae.
MolecularBiologyandEvolution30(12):2602-2611(2013IF:14.308)
49LiQ-G,ZhangY-M*.2013.TheoriginandfunctionaltransitionofP34.Heredity110(3):
259-266
48WenJia,CanVanToan,ZhangY-M*.2013.Multi-QTLmappingforquantitativetraitsusing
distortedmarkers.MolecularBreeding31(2):395-404
47NiuYuan,XuYu,LiuXiao-Feng,YangSheng-Xian,WeiShi-Ping,XieFang-Teng,ZhangY-M*.
2013.Associationmappingforseedsizeandshapetraitsinsoybeancultivars.Molecular
Breeding31(4):785-794
46XieShang-Qian,JiaWen,ZhangY-M*.2013.Multi-QTLmappingforquantitativetraitsusing
epistaticdistortedmarkers.PLoSONE8(7):e68510
45FengJ-Y,ZhangJ,ZhangW-J,WangS-B,HanS-F,ZhangY-M*.2013.Anefficient
hierarchicalgeneralizedlinearmixedmodelformappingQTLofordinaltraitsincrop
cultivars.PLoSONE8(4):e59541
44ZhangT*,QianN,ZhuX,ChenH,WangS,MeiH,ZhangY.2013.Variationsandtransmission
ofQTLallelesforyieldandfiberqualitiesinuplandcottoncultivarsdevelopedinChina.
PLoSONE8(2):e57220
2012
43LiC,LiQ-G,JimM.Dunwell,ZhangY-M*.2012.Divergentevolutionarypatternofstarch
biosyntheticpathwaygenesingrassesanddicots.MolecularBiologyandEvolution29(10):
3227-3236(2012IF:10.353)
42ZhangJ,YueC,ZhangY-M*.2012.BiascorrectionforestimatedQTLeffectsusingthe
penalizedmaximumlikelihoodmethod.Heredity108:396-402
41LiC,LiM,JimM.Dunwell,ZhangY-M*.2012.Geneduplicationandaccelerated
evolutionaryratecontributetothehigherabilityofproteinsynthesisindicots.
BMCEvolutionaryBiology12:15
40HeXiao-Hong,HuZhongli,ZhangY-M*.2012.Genome-widemappingofQTLassociatedwith
heterosisintheRIL-basedNCIIIdesign.ChinSciBull57(21):2655-2665
39LiuR,WangB,GuoW,QinY,WangL,ZhangY,ZhangT*.2012.Quantitativetraitloci
mappingforyieldanditscomponentsbyusingtwoimmortalizedpopulationsofa
heterotichybridinGossypiumhirsutumL.MolecularBreeding29(2):297-311
38JiangboZhou,Yuan-MingZhang,HaiyanLü,AiqingYou,LiliZhu,GuangcunHe*.2012.
Transmissionofimportantchromosomalregionsunderselectionrevealedinricepedigree
breedingprograms.MolecularBreeding30(2):717-729
37ChenX,GuoW,LiuB,ZhangY,SongX,ZhangL,ZhangT*.2012.Molecularmechanismsof
fiberdifferentialdevelopmentbetweenG.barbadenseandG.hirsutumrevealedby
geneticalgenomics.PLoSONE7(1):e30056
36GuoH-L,LiY,XuanJ-P,LiuJ-X*,ZhangY-M,ZhengYi-Qi.2012.Associationof
molecularmarkerswithcoldtoleranceandgreenperiodinZoysiagrass(ZoysiaWilld.).
BreedingScience62:320-327
2011
35LiC,ZhangY-M*.2011.Molecularevolutionofglycininandβ-conglyciningene
familiesinsoybean(GlycinemaxL.Merr.).Heredity106:633-641
34XuY,LiH-N,LiG,WangX,ChengL,ZhangY-M*.2011.Mappingquantitativetraitloci
forseedsizetraitsinsoybean(GlycinemaxL.Merr.).TheorApplGenet,122:581-594
33HeX-H,QinH,HuZ,ZhangT,ZhangY-M*.2011.Mappingofepistaticquantitativetrait
lociinfour-waycrosses.TheorApplGenet122:33-48
32LüH-Y,LiuX-F,WeiS-P,ZhangY-M*.2011.Epistaticassociationmappinginhomozygous
cropcultivars.PLoSONE6(3):e17773
31HeX-H,ZhangY-M*.2011.Acompletesolutionfordissectingpuremainandepistatic
effectsofQTLintripletestcrossdesign.PLoSONE6(9):e24575
30KuangF-L,WangX,ZhouL,ZhangY-M*.2011.Linkagegraphanalysis:Alinkage-group-based
QTLsynthesisanalysisapproach.ChinaSciBull56:1092-1099
29ZhuX,AiN,ZhangY,GuoW,ZhangT-Z*.2011.Relationshipsbetweendifferentialgene
expressionandheterosisincottonhybridsdevelopedfromthefoundationparentCRI-12and
itspedigree-derivedlines.PlantScience180:221-227
2010
28DouBD*,HouBW,WangF,YangJB,NiZF,SunQX,ZhangY-M*.2010.Furthermappingof
quantitativetraitlociforfemalesterilityinwheat.GeneticsResearch92(1):63-70
27LiuG,LiM,WenJ,DuY,ZhangY-M*.2010.Functionalmappingofquantitativetrait
lociassociatedwithricetillering.MolecularGeneticsandGenomics284:263-271
26LiG-J,LIH-N,ChengL-G,ZhangY-M*.2010.QTLAnalysisforDynamicExpressionof
ChlorophyllContentinSoybean(GlycinemaxL.Merr.)ActaAgronomicaSinica36(2):
242-248
2009
25LüH-Y,LiM,YaoL-L,LiG-J,LinF,ZhangY-M*.2009.Multi-lociinsilicomappingin
inbredlines.Heredity103:346-354
24ZhangY-M*,GaiJY.2009.MethodologiesforsegregationanalysisandQTLmappingin
plant.ThethirdInternationalConferenceonQuantitativeGenetics.Genetica136:311-318
2008
23HeX-H,ZhangY-M*.2008.Mappingepistaticquantitativetraitlociunderlyingendosperm
traitsusingallmarkersontheentiregenomeinrandomhybridizationdesign.Heredity101:
39-47
22ZhangY-M*,LüH-Y,YaoL-L.2008.MultiplequantitativetraitlociHaseman-Elston
regressionusingallmarkersontheentiregenome.TheorApplGenet117:683-690
21ZhuC,ZhangY-M*,GuoZ.2008.Mappingquantitativetraitlociforbinarytraitinthe
F2:3design.JournalofGenetics87(3):201-207
20QinH,GuoW,ZhangY-M,ZhangTZ*.2008.QTLmappingofyieldandfibertraitsbasedon
afour-waycrosspopulationinGossypiumhirsutumL.TheorApplGenet117:883-894
2007
19ZhuC,WangC,ZhangY-M*.2007.Modelingsegregationdistortionforviabilityselection
I.Reconstructionoflinkagemapswithdistortedmarkers.TheorApplGenet114:295-305
18ZhuC,ZhangY-M*.2007.AnEMalgorithmformappingsegregationdistortionloci.BMC
Genetics8:82
17ZhuC,HuangJ,ZhangY-M*.2007.MappingbinarytraitlociintheF2:3design.Journal
ofHeredity98:337-344
16GengJ,ZhuC,ZhangX,ChengY,ZhangY-M*,HouX*.2007.Ageneticlinkagemapof
nonheadingchinesecabbage.JournalofAmericanSocietyforHorticulturalScience
132:816-823
15ZhuC,WangF,WangJ ，LiG
，ZhangH*,ZhangY-M*.2007.Reconstructionoflinkagemaps
inthesegregationpopulationsofbackcross,doublehaploidandrecombinantinbredline.
ChinSciBull52:1648-1653
14WangX,HuZ,WangW,LiY,ZhangY-M,XuC*.2007.Amixturemodelapproachtothe
mappingofQTLcontrollingendospermtraitswithbulkedsamplesStatus.Genetica132:
59-70
2006
13ZhangY-M*.2006.AdvancesonmethodsformappingQTLinplants.ChinaSciBull51:
2223-2231
12ZhangY-M*.2006.Shrinkageestimationmethodformappingmultiplequantitativetrait
loci.ActaGeneticaSinica33(10):861-869
11XueY,WanJ*,JiangL,WangC,LiuL,ZhangY-M,ZhaiH.2006.Identificationof
quantitativetraitlociassociatedwithaluminumtoleranceinrice(OryzasativaL.).
Euphytica150:37-45
2005
10ZhangY-M,MaoY,XieC,SmithH,LuoL,XuS*.2005.Mappingquantitativetraitloci
usingnaturallyoccurringgeneticvarianceamongcommercialinbredlinesofmaize(Zea
maysL.).Genetics169:2267-2275
9WangH,ZhangY-M,LiX,MasindeGL,MohanS,BaylinkDJ,XuS*.2005.Bayesian
shrinkageestimationofquantitativetraitlociparameters.Genetics170:465-480
(Comment:NatRevGenet2006,7:229-237)
8ZhangY-M,XuS*.2005.Apenalizedmaximumlikelihoodmethodforestimating
epistaticeffectsofQTL.Heredity95:96-104
7LuoL,ZhangY-M,XuS*.2005.Aquantitativegeneticsmodelforviabilityselection.
Heredity94:347-355(EditorComment:Heredity200594:273-274)
6XuC,ZhangY-M,XuS*.2005.AnEMalgorithmformappingquantitativeresistance
loci.Heredity94:119-128
5ZhangY-M,XuS*.2005.Advancedstatisticalmethodsfordetectingmultiple
quantitativetraitloci.RecentResearchDevelopmentsinGeneticsandBreeding2:
1-23(InvitedReview)
4HansenC,YiN,ZhangY-M,XuS,GavoraJ,ChengHH*.2005.IdentificationofQTLfor
productiontraitsinchickens.AnimalBiotechnology16:67-79
2004
3ZhangY-M,XuS*.2004.MappingquantitativetraitlociinF2incorporatingphenotypes
ofF3progeny.Genetics166:1981-1993
2003
2ZhangY-M*,GaiJY,YangY-H.2003.TheEIMalgorithminthejointsegregationanalysis
ofquantitativetraits.GeneticsResearch81:157-163
1TaoA,ZengH,ZhangY-M，XieG-S,QinF-L,ZhengY-L,ZhangD-P*.2003.Genetic
analysisofthelowcriticalsterilitytemperaturepointinphotoperiod-thermosensitive
genicmalesterilerice.ActaGeneticaSinica30(1):40-48

2009年以来的中文学术论文（2009年以前的中文论文未列入）
1程利国,李广军,刘玉芹,李河南 ，章元明.大豆对大豆花叶病毒Sa株系抗扩展特性的遗传分析.
南京农业大学学报,2009,32(4):1317
2李河南
，汪霞，李广军 ，程利国
，何小红，张国政 ，章元明。大豆粒形的主基因+多基因混合遗传
。
大豆科学2009，28(1):16-20
3李广军
，李河南，程利国 ，章元明。大豆对豆卷叶螟抗性的QTL定位 。中国油料作物学报2009
，
31(3):365-369
4匡峰磊,汪霞,周玲,章元明
。关联图分析:一种基于连锁图的QTL综合分析方法。科学通报
2010，55(29):2828-2836
5李广军 ，李河南
，程利国，章元明 。大豆叶绿素含量动态表达的QTL分析
。作物学报2010 ，
36(2):242-248
6汪霞
，徐宇，李广军 ，李河南
，艮文全，章元明。大豆百粒重QTL定位 。作物学报2010 ，
36(10):1674-1682
7魏世平，刘晓芬
，杨胜先，吕海燕 ，牛远
，章元明
。中国栽培大豆群体结构不同分类方法的比较.
南京农业大学学报2011,34(2):13-17
8汪霞，徐宇 ，李广军
，李河南，章元明。大豆株高QTL定位及Meta分析.南京农业大学学报
2011,34(3):13-19
9章元明.植物数量遗传学的建立
、发展与展望.南京农业大学学报2012,35(5):19-24
10牛远 ，徐宇
，李广军，王云清 ，刘晓芬
，李河南，魏世平 ，章元明 。大豆籽粒大小和粒形的驯化
研究
。大豆科学2012，31(4):522-528
11曹锡文
，刘兵，章元明.植物数量性状分离分析Windows软件包SEA的研制。南京农业大学学报
2013,36(6):1-6
12闫宁 ，谢尚潜
，耿青春，徐宇 ，李广军
，刘兵，汪霞 ，李其刚
，章元明 。利用Bayes分层广义
线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础。作物学报2013，39(2):258-268
13牛远 ，谢芳腾
，布素红，谢尚潜 ，韩世凤，耿青春
，刘兵，章元明
。大豆粒形性状QTL的精细
定位。作物学报2013 ，39(4):609-616

教材与专著
1、ZhangY-M*.2012.F2designsforQTLanalysis.In:ScottA.Rifkin(ed.),Quantitative
TraitLoci(QTL):MethodsandProtocols.MethodsinMolecularBiology871:17-29.
DOI10.1007/978-1-61779-785-9_2.SpringerScience+BusinessMedia,LLC
2 、盖钧镒
、章元明、王建康 。植物数量性状遗传体系
。科学出版社
，2003
3 、谢庄、章元明主编。水产试验统计学 。中国农业科技出版社，1998
4
、盖钧镒主编 ，章元明统稿
。试验统计方法。农业出版社
，2000
5、章元明主编 。生物统计学（生物技术专业用）
。农业出版社（待出版）
6 、徐辰武
、章元明主编。生物统计与试验设计 。高等教育出版社（待出版）